bethe_hessian_matrix#
- bethe_hessian_matrix(G, r=None, nodelist=None)[source]#
返回 G 的 Bethe Hessian 矩阵。
Bethe Hessian 是由参数 r 参数化的一系列矩阵,定义为 H(r) = (r^2 - 1) I - r A + D,其中 A 是邻接矩阵,D 是节点度的对角矩阵,I 是单位矩阵。当正则器 r = 1 时,它等于图拉普拉斯矩阵。
默认的正则器选择应为比率 [2]
\[r_m = \left(\sum k_i \right)^{-1}\left(\sum k_i^2 \right) - 1\]- 参数:
- GGraph
一个 NetworkX 图
- rfloat
正则化参数
- nodelistlist, optional
行和列按照 nodelist 中的节点排序。如果 nodelist 为 None,则排序由
G.nodes()
生成。
- 返回:
- Hscipy.sparse.csr_array
图
G
的 Bethe Hessian 矩阵,参数为r
。
另请参阅
Bethe Hessian 谱
邻接矩阵
拉普拉斯矩阵
参考文献
[1]A. Saade, F. Krzakala 和 L. Zdeborová “使用 Bethe Hessian 进行图的谱聚类”,载于 Advances in Neural Information Processing Systems, 2014。
[2]C. M. Le, E. Levina “使用谱方法估计网络中的社区数量” arXiv:1507.00827, 2015。
示例
>>> k = [3, 2, 2, 1, 0] >>> G = nx.havel_hakimi_graph(k) >>> H = nx.bethe_hessian_matrix(G) >>> H.toarray() array([[ 3.5625, -1.25 , -1.25 , -1.25 , 0. ], [-1.25 , 2.5625, -1.25 , 0. , 0. ], [-1.25 , -1.25 , 2.5625, 0. , 0. ], [-1.25 , 0. , 0. , 1.5625, 0. ], [ 0. , 0. , 0. , 0. , 0.5625]]) ----
其他后端实现了此函数
graphblas : 启用 OpenMP 的稀疏线性代数后端。